คณะสหวิทยาการ มหาวิทยาลัยขอนแก่น ได้เริ่มก่อตั้งตาม ประกาศมหาวิทยาลัยขอนแก่น ฉบับที่ ๖๓๕/๒๕๖๓ เรื่อง การจัดตั้งส่วนงานของมหาวิทยาลัยขอนแก่น (ฉบับที่ ๕) พ.ศ. ๒๕๖๓[1] ลงวันที่ 1 เมษายน พ.ศ. 2563 ซึ่งราชกิจจานุเบกษาได้เผยแพร่เมื่อวันที่ 10 กรกฎาคม 2563[2] โดยเกิดจากการควบรวมส่วนคณะวิชาเดิม 4 คณะและ 1 หน่วยงานของมหาวิทยาลัยขอนแก่น วิทยาเขตหนองคาย ได้แก่ สำนักงานวิทยาเขตหนองคาย, คณะวิทยาศาสตร์ประยุกต์และวิศวกรรมศาสตร์, คณะบริหารธุรกิจ, คณะสังคมศาสตร์บูรณาการ และ คณะศิลปศาสตร์ ส่งผลให้คณะสหวิทยาการกลายเป็นคณะที่มีพื้นที่บริการใหญ่ที่สุดของมหาวิทยาลัยขอนแก่น